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计算机辅助药物设计实验教程罗海彬,张晨编 9787306073518 中山大学出版社

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作者: 罗海彬,张晨编
出版社: 中山大学出版社
ISBN: 9787306073518

出版时间: 2021-12
装帧: 平装
开本: 16开

作者: 罗海彬,张晨编
出版社: 中山大学出版社

ISBN: 9787306073518
出版时间: 2021-12

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综合性图书

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1202567658

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目录
第一章  定量构效关系(QSAR)

一、实验目的

二、实验要求

三、实验原理

1  比较分子力场分析方法(CoMFA)

2  比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)

四、实验内容

1  背景介绍

2  实验操作

【参考文献】

第二章  药效团模型

一、实验目的

二、实验要求

三、实验原理

1  药效团特征的种类

2  药效团模型的构建

3  基于药效团模型药物设计方法的应用

四、实验内容

1  背景介绍

2  实验操作

【参考文献】

第三章  结构优化

一、实验目的

二、实验要求

三、实验原理

四、实验内容

1  构建化合物并优化结构

2  保证水分子的C2v点群

3  保证Ge6的Oh对称性计算

4  同分异构体的单点能计算

5  静电势表面ESP(Electrostatic potential surfaces)计算

6  观察分子振动

7  预测红外光谱和拉曼光谱

第四章  分子对接

一、实验目的

二、实验要求

三、实验原理

四、实验内容

1  LibDock对接方法及蛋白-配体相互作用的打分评价

2  CDOCKER和对接姿态分析

3  SYBYL软件的分子对接模块Surflex-Dock

4  MOE软件的分子对接模块Dock

5  总结

【参考文献】

第五章  分子动力学模拟

一、实验目的

二、实验要求

三、实验原理

四、实验内容

1  普瑞巴林的溶剂化模型及分子动力学模拟

2  MDM2-抑制剂复合物的分子动力学模拟

【参考文献】

内容摘要
本书共五章：第一章介绍定量构效关系，并针对选择性环氧合酶抑制剂开展三维定量构效关系研究实验。第二章以表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂为例，对基于药效团模型虚拟筛选进行详细讲解。第三章由七个独立子实验组成，内容涵盖点群计算、单电能计算、静电势表面计算等。第四章分子对接，集中讲解了四种常用对接方法的实验操作。第五章以“普瑞巴林”和“MDM2—抑制剂复合物”为研究对象，对分子动力学模拟实验操作进行讲解。
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