第1章 数据预处理 1
1.1 异常值的常见处理方法 1
1.2 缺失值的填补 8
第2章 多元线性回归分析 14
2.1 多元线性回归的概念 14
2.2 多元线性回归的模型结构 14
2.3 多元逐步线性回归 17
第3章 Logistic回归分析 22
3.1 Logistic回归分析的基本概念 22
3.2 Logistic回归的模型结构 22
3.3 应用实例1:一般资料的Logistic回归 23
3.4 应用实例2:列联表资料的Logistic回归 27
3.5 应用实例3:多项Logistic回归分析 29
第4章 非线性回归拟合分析 32
4.1 非线性回归基本概念 32
4.2 应用实例1:对新增SARS病例数的预测分析 32
4.3 应用实例2:对累计SARS病例数的预测分析 37
第5章 生存分析 41
5.1 生存分析的基本概念 41
5.2 生存分析的资料特点 41
5.3 生存资料的分析方法 42
5.4 应用实例1:累积生存率的计算 42
5.5 应用实例2:小样本生存率的Kaplan-Meier估计 45
5.6 应用实例3:生存曲线比较的Log-rank检验 47
5.7 应用实例4:Cox回归 51
5.7.1 Cox模型结构与参数估计 51
5.7.2 应用实例:Cox回归分析 51
第6章 基于竞争风险模型的生存分析 56
6.1 竞争风险模型 56
6.2 应用实例:竞争风险模型的生存分析 56
第7章 Meta分析 62
7.1 Meta分析概述 62
7.2 Meta分析的方法与步骤 62
7.3 应用实例1:二分类资料的Meta分析 63
7.4 应用实例2:连续资料的Meta分析 71
第8章 剂量-反应模型的Meta分析 77
8.1 剂量-反应关系的数据结构 77
8.2 线性拟合 78
8.3 非线性拟合-三次曲线拟合 79
第9章 决策树模型分析 82
9.1 分类的概念 82
9.2 分类的步骤 82
9.3 分类器性能的评估 83
9.4 决策树分类器简介 83
9.5 应用实例:决策树分析 85
第10章 随机森林法提取特征属性 88
10.1 随机森林方法基本概念 88
10.2 基于平均基尼指数减少量的特征属性选择 88
10.3 应用实例:随机森林法提取特征属性 90
第11章 倾向性得分匹配方法 94
11.1 倾向性得分匹配方法 94
11.2 倾向性得分匹配方法的步骤 94
11.3 应用实例:倾向性得分匹配 95
第12章 用广义估计方程分析重复测量的定性资料 102
12.1 广义估计方程的基本概念 102
12.2 广义线性模型的结构 102
12.3 GEE算法 103
12.4 应用实例1:重复测量的实验数据 103
12.5 应用实例2:问卷调查中的多选题数据 105
第13章 基于支持向量机的微阵列数据分类 109
13.1 支持向量机简介 109
13.2 支持向量机的基本原理 109
13.3 应用实例:支持向量机分类 111
第14章 时间序列分析 113
14.1 时间序列分析的基本概念 113
14.2 时间序列分析的主要步骤 113
14.3 应用实例:时间序列分析 114
第15章 路径图分析 118
15.1 路径图分析基本理论 118
15.2 路径图分析的基本步骤 118
15.3 应用实例:路径图分析 119
15.3.1 第一个回归分析 119
15.3.2 第二个回归分析 121
15.3.3 第三个回归分析 122
第16章 主成分分析与因子分析 124
16.1 主成分分析概念 124
16.2 应用实例1:主成分分析 124
16.3 因子分析概念 129
16.4 应用实例2:因子分析 129
第17章 判别分析 134
17.1 判别分析的概念 134
17.2 常用的判别分析方法 134
17.3 判别函数的验证 135
17.4 应用实例:判别分析 135
第18章 聚类分析 144
18.1 聚类分析的概念 144
18.2 K均值聚类法 144
18.3 应用实例1:K均值聚类 145
18.4 系统聚类法 148
18.5 应用实例2:系统聚类 149
18.6 绘制双向聚类热图 153
第19章 关联规则 156
19.1 关联规则的基本概念 156
19.2 关联规则的质量和重要性 156
19.3 关联规则分析的基本方法 157
19.4 应用实例:关联规则分析 157
第20章 两组ROC曲线下的面积比较 161
20.1 ROC曲线的构建 161
20.2 ROC曲线下面积 162
20.3 两组ROC曲线下面积比较 162
20.4 应用实例:两组ROC曲线下面积比较 162
第21章 诊断准确性试验Meta分析 166
21.1 诊断准确性试验Meta分析基本概念 166
21.2 诊断准确性试验Meta分析的相关评价指标 166
21.3 应用实例:诊断准确性试验Meta分析 167
第22章 贝叶斯网络分析 173
22.1 贝叶斯网络的概念 173
22.2 应用实例:贝叶斯网络构建 174
第23章 偏最小二乘回归分析 179
23.1 偏最小二乘回归的基本步骤和原理 179
23.2 应用实例:偏最小二乘回归分析 180
参考文献 185