《中国学术流变(上下)(精)/冯天瑜文存》新版保留原版综论、先秦、秦汉、魏晋南北朝、隋唐五代、宋元、明、清八部分,增加民国及现代部分,共为九章。前八章补人若干新篇目,包括港台学者、海外华裔学者、外国汉学家的论述,以扩大观察中国学术流变的视野。如唐君毅以《易经》元亨利贞仁义礼智之序,言中国学术精神之发展,还将中国历代文化精神与西方历代文化精神作比较,观其同中之异,异中之同。又如英国汉学家李约瑟致力于开掘中国传统学术中的科学人道精神。这些论说都为中国学术史研究开辟新境界。
新版还择要反映由考古发掘、文献披露所推动的对学术史的新认识,如甲骨文的发现与破译,拓展研究殷商文化的视野,提供了“释古”以重建古史的可能:敦煌文书、汉晋木简的再见天日,打开中古史的渊富宝藏;楚简的联翩出土,揭开先秦及秦汉学术的原始状貌,以至有学者认为楚地简帛文书的发现,有必要改写先秦及秦汉学术史;而明清“大内档案”的面世,扩展并加深了对明清学术的理解。总之,新版博采新论说、新材料,意在求得中国学术流变较深广的观照。
《中国学术流变(上下)(精)/冯天瑜文存》各部分前均由编者撰写提要,录文则按如下顺序编排:A.对一代学术流变的概括;B.对各学派、学者的分论(对同一学派也先列总论,后列分论)。录文标题为编者所加者,均以*号注明。部分录文中之夹注经编者删除者,在录文标题处加注释说明。选录自诸子书及二十五史者一律不注作者姓名。录文版本尽量采用近五十年出版的标点本。录文中的繁体字、异体字在不导致歧义的前提下改为规范简体字。原文版式为竖排者,一律改为横排。一些现代学者遵从当时流行的泛化封建说,将非封建的秦汉以降两千年称“封建时代”,此不妥当,然本编仍保存选文原态。