全新正版二穗短柄草中抗病基因家族的分析及机器学习预测方法研究谭生龙//陈利红|责编:杨粮菊//涂昀 9787568921817 重庆大学

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作者: 谭生龙//陈利红|责编:杨粮菊//涂昀
出版社: 重庆大学
ISBN: 9787568921817

出版时间: 2020-08
装帧: 平装
开本: 其他

作者: 谭生龙//陈利红|责编:杨粮菊//涂昀
出版社: 重庆大学

ISBN: 9787568921817
出版时间: 2020-08

装帧: 平装
开本: 其他

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医药卫生

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31092036

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目录
1  绪论
  1.1  植物抗病基因概述
  1.2  植物抗病基因研究中的生物信息学
  1.3  常用生物信息学数据库和分析软件
  1.4  本书的技术线路图
  1.5  本书的主要内容
  1.6  本书的目的和意义
2  二穗短柄草抗病基因家族NBS.LRR的鉴定与生物信息学
  分析
  2.1  引言及研究动机
  2.2  数据与方法
  2.3  结果与分析
  2.4  讨论与小结
3  二穗短柄草NBS.LRR抗病基因家族的表达谱分析
  3.1  引言及研究动机
  3.2  基因表达谱分析的常用技术
  3.3  实验数据的获取
  3.4  结果与分析
  3.5  讨论与小结
4 NBS—LRR基因家族预测算法的设计与应用
  4.1  研究背景
  4.2  方法与数据集
  4.3  结果与分析
5  总结与展望
  5.1  主要研究结果
  5.2  创新点
  5.3  展望
附录
  附录l  缩略词简表
  附录2  NBS—LRR抗病基因列表
  附录3  二穗短柄草中我们鉴定出的126个典型的NBS—LRR抗病基因的蛋白序列
  附录4  NBS一LRR抗病基因的基因簇分布
  附录5  氨基酸的部分理化性质简表
  附录6  拟南芥中的正负样本序列列表
  附录7  NBS—LRR抗病基因的蛋白序列结构域特征
参考文献

内容摘要
抗病基因对植物的生长发育起着非常重要的免疫调控作用，植物中抗病基因的数量和特征对该植物的抗病机制研究至关重要
。本书选择禾本科植物二穗短柄草作为研究对象，系统鉴定了该物种内最重要的一类抗病基因家族，这类抗病基因所编码的蛋白具有核苷酸结合结构域
（NBS，NucleotideBindingSite）和亮氨酸重复结构域（LRR，Leucine—RichRepeats），并系统
分析了这些抗病基因。在获得二穗短柄草中的NBS一LRR抗病基因列表后，继续研究了其数字序列特征
，并应用机器学习中的支持向量机算法对这些特征
进行训练建模，构建和优化后的机器学习模型，可实现对其他已测序物种的快速抗病基因鉴定。本书可供基因分析及机器预测学习方法研究人员参考。
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