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[美]A.M.莱斯克 著; 薛庆中 译 / 科学出版社 / 2015-12 / 精装
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基因组学概论(第二版)
《基因组学概论(第二版)》的内容框架设计独具匠心,作者把基因组比拟为生物学研究的集线器。由此分层次介绍了DNA、蛋白质序列和结构、基因组、蛋白质组、转录组和系统生物学内容,也分别对原核生物、真核生物、人类基因组结构和特性进行了介绍和比较,并将基因组变化和进化联系起来。《基因组学概论(第二版)》的布局特别适合教学需要,每章均先指明学习目标,学习内容有章有节,循序渐进,逐步展开,关键字设有标签进行简要说明。《基因组学概论(第二版)》的图表丰富,有助理解,每章结束时提供了参考文献,让有兴趣的读者深究;布置的练习,可帮助读者复习和进一步思考,而网络问题则能引导读者借助于各种网络工具深入学习和研究基因组。
译者序第二版前言第一版前言第二版概述第二版新内容第1章基因组学概论11.1人类基因组21.2人类基因组的内容41.3编码蛋白质组的基因71.4基因组结构种类111.4.1染色体、细胞器和质粒111.4.2基因121.4.3基因组的动态组成151.5基因组测序计划171.6种群内和种群间的差异211.7人类基因组测序211.8人类基因组和医学*221.8.1疾病的预防231.8.2检测和精确诊断241.8.3有效治疗手段的发现和实施241.8.4卫生保健服务241.9数据库的进化和发展251.9.1数据库的进化和发展(evo-devo)261.9.2基因组浏览器271.10蛋白质进化:物种内和物种间序列及结构的分歧321.11伦理、法律和社会问题321.12推荐阅读361.13练习、问题和网络问题37第2章基因组是生物学的集线器(Hub)412.1个体、群体、生物圈:过去、现在和未来422.2中心法则和周边规则432.3表达模式432.3.1基因表达的调控442.3.2蛋白质组学492.3.3基因组学和发育生物学492.3.4基因和思维:神经基因组学512.4群体542.4.1单核苷酸多态性和单体型542.4.2临床上重要的单体型:主要组织相容性复合物*582.4.3突变和疾病592.5遗传性疾病的诱因及其治疗的病例*612.5.1血红蛋白病是由异常血红蛋白引发的分子疾病612.5.2苯丙酮尿症622.5.3阿尔茨海默病642.5.4SNP和癌症642.6物种682.7生物圈692.7.1物种灭绝702.7.2袋狼的灭绝722.7.3麋鹿的幸存722.8推荐阅读742.9练习、问题和网络问题75第3章图谱、测序、注释和数据库823.1经典遗传学背景833.2图谱和旅行指南843.2.1遗传图谱853.2.2连锁863.2.3连锁不平衡873.2.4染色体带型图893.2.5直接基于DNA序列的高分辨率图谱923.2.6限制性酶切图谱933.3DNA结构的发现943.4DNA测序983.4.1FrederickSanger和DNA测序的发展983.4.2Maxam-Gilbert化学裂解法1033.4.3DNA自动化测序1033.5组织大规模测序计划1053.5.1产生克隆:分层或“BACtoBAC”基因组测序1053.5.2全基因组鸟枪法测序1063.5.3高通量测序1073.5.4生命科学技术的快速发展(lifeinthefastlane)1113.6分子生物学数据库1123.6.1核酸序列数据库1133.6.2蛋白质序列数据库1143.6.3遗传性疾病数据库:OMIM和OMIA*1143.6.4结构数据库1143.6.5蛋白质结构的分类1153.6.6专业或精品(boutique)数据库1153.6.7表达和蛋白质组学数据库1153.6.8代谢路径数据库1173.6.9文献数据库1183.6.10分子生物学数据库和服务器概观1183.7推荐阅读1183.8练习、问题、网络问题119第4章比较基因组学1244.1引言1254.2生命的一致性和多样性1254.3基因组的大小和结构1314.4病毒基因组1344.4.1重组病毒1364.4.2流感:过去和当前的威胁*1364.5原核生物的基因组结构1404.5.1复制和转录1424.5.2基因转移1424.6真核生物基因组结构1424.7如何区别基因组1444.7.1单核苷酸水平的多样性1444.7.2复制1454.7.3染色体水平上的比较:共线性1544.8是什么让我们成为人类?1544.8.1比较基因组学1544.8.2结合的方法:FOXP2基因1564.9黑猩猩和人类基因组1564.10小鼠和大鼠基因组1574.11研究人类疾病的模式生物*1584.11.1秀丽隐杆线虫基因组1584.11.2黑腹果蝇基因组1594.11.3人类、线虫和果蝇的同源基因1604.12DNA元件百科全书计划1634.13推荐阅读1664.14练习、问题和网络问题167第5章进化和基因组变化1725.1进化是探索1735.2生物系统学1755.2.1生物学命名1755.2.2生物学相似性和差异性的测定1765.3同源性和家族1785.4模式匹配——生物信息学的基本工具1785.4.1序列比对1795.4.2最佳比对的定义1835.4.3快速扫描数据库的近似方法1855.4.4三维结构的匹配模式1885.5蛋白质序列、结构及功能的进化1905.5.1单个点突变的影响1915.5.2蛋白质结构和功能的进化1925.6系统发育1935.6.1系统进化树1965.6.2聚类法1975.6.3分支法1985.6.4进化率变化的问题1995.6.5贝叶斯法2005.7快速进化:遗传工程2005.8推荐阅读2015.9练习、问题及网络问题202第6章原核生物基因组2056.1原核生物进化与系统发育的关系2066.1.1原核生物的主要类型2076.1.2是否了解生命系统发生树的根源?2096.2古细菌2106.2.1甲烷球菌基因组2116.2.2极端温度下的生命2126.2.3超嗜热古菌比较基因组学:热球菌和火球菌2166.3细菌2196.3.1致病菌基因组*2206.3.2基因组学和疫苗的研发*2226.4宏基因组学:同一个环境样品中收集的全部基因组2236.5推荐阅读2276.6练习、问题和网络问题228第7章真核生物基因组2307.1真核生物的起源和进化2317.2真核生物的进化及其系统发育关系2317.2.1酵母基因组2327.2.2植物的进化2337.2.3玻璃海鞘基因组2367.2.4河豚基因组2387.2.5鸡基因组2407.2.6鸭嘴兽基因组2417.2.7狗基因组2437.3古测序(Palaeosequencing)-古DNA2467.4灭绝鸟类的DNA2477.4.1新西兰恐鸟2477.4.2渡渡鸟和愚鸠2507.5猛犸象DNA高通量测序2507.5.1猛犸象核基因组2517.5.2大象系统发育2517.6推荐阅读2527.7练习、问题和网络问题253第8章基因组学和人类生物学2558.1个性化鉴定基因组学2568.1.1线粒体DNA2588.1.2性别鉴定2588.1.3体型特征2598.2作物驯化2598.2.1玉米2618.2.2水稻2648.2.3可可2648.2.4可可基因组2678.3人类基因组学2698.3.1尼安德特人基因组2698.3.2古代人类群体及其迁徙2708.4基因组学和语言2788.5推荐阅读2798.6练习、问题和网络问题281第9章芯片和转录组学2839.1简介2849.2芯片数据分析2869.3不同生理状态的表达模式2909.3.1酿酒酵母的两阶段生长转变2909.3.2大鼠和果蝇的休眠2949.4发育表达模式的变化2969.4.1黑腹果蝇生命周期表达模式的变化2969.4.2玫瑰花的形成2989.5学习和记忆的表达模式:长时程增强3029.6表达模式的进化3079.7芯片在医学上的应用*3099.7.1抗生素耐药性细菌的发展3099.7.2儿童白血病3139.8全转录组鸟枪法测序:RNA测序3159.9推荐阅读3169.10练习、问题和网络问题317第10章蛋白质组学31910.1引言32010.2蛋白质的性质和类型32010.3蛋白质结构32110.3.1蛋白质化学结构32110.3.2多肽链的构象32310.3.3蛋白质折叠模式32510.4翻译后修饰32710.5蛋白质分离和分析32910.5.1聚丙烯酰胺凝胶电泳33010.5.2二维聚丙烯酰胺凝胶电泳33010.5.3质谱33110.6蛋白质结构的分类33410.6.1蛋白质结构分类数据库33510.6.2蛋白质进化过程中折叠模式的变化33610.7许多蛋白质将构象改变作为它们功能机制的一部分33710.7.1酶催化过程中的构象变化33810.7.2马达蛋白34010.7.3蛋白质功能的变构调节34310.7.4丝氨酸蛋白酶抑制剂的构象状态34610.8蛋白质结构预测和建模34710.8.1同源建模34810.8.2蛋白质结构预测的有效方案35210.8.3结构基因组学35310.9定向进化和蛋白质设计35310.9.1枯草杆菌蛋白酶E的定向进化35410.9.2酶的设计35510.10蛋白质复合物和聚合体35510.10.1蛋白质聚集疾病*35610.10.2蛋白质-蛋白质复合物的特性35810.10.3多亚基蛋白36010.11推荐阅读36110.12练习、问题和网络问题362第11章 系统生物学36611.1系统生物学介绍36711.1.1两个平行的网络:物理和逻辑36711.1.2网络的静力学和动力学36811.2网络图36911.3系统生物学的思想来源37211.3.1序列的复杂性37211.3.2香农熵的定义37311.3.3序列的随机性37411.3.4静态和动态的复杂性37511.3.5计算机的复杂性37611.4代谢组学37711.4.1蛋白质功能的分类和分配37711.4.2代谢网络38111.4.3代谢途径数据库38211.4.4大肠杆菌内甲硫氨酸的合成38211.4.5京都基因与基因组百科全书38411.4.6代谢路径的进化和系统发生38511.4.7古细菌的碳水化合物代谢38711.4.8代谢网络的重建38911.5调控网络38911.5.1信号转导和转录调控39011.5.2调控网络的结构39111.6动
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开播时间:09月02日 10:30