细胞自噬

细胞自噬是基本的生物学过程，使细胞在饥饿和其他形式的胁迫期间能够自动消化其自身的胞质成分。目前自噬在感染、免疫、衰老、发育、神经退行性疾病和癌症生物学中的作用得到日益广泛的重视。《细胞自噬》向读者介绍了有关自噬的基础知识，重点描述了自噬在免疫中的功能以及具有高度适应性的病原体为抵抗自噬所使用的对抗机制，同时还提供了自噬在感染免疫中的作用的最新研究进展。

《细胞自噬》可供医学、生物学等相关学科的广大本科生、研究生及其他科研人员阅读参考。

第1章自噬分子机制概述
1.1引言
1.2自噬的分子机制
1.2.1自噬的诱导和调节
1.2.2Cvt途径和其他具有选择性的自噬类型
1.2.3磷脂酰肌醇3激酶复合物
1.2.4两种泛素样蛋白质缀合系统（conjugationsystem）
1.2.5Atg9及其循环系统
1.2.6囊泡的从头形成
1.2.7囊泡与液泡的对接和融合
1.2.8囊泡分解以及所产生大分子的循环利用
1.3结论
参考文献
经2章大自噬的信号传导及调节
2.1引言
2.2信号传导通路
2.2.1TOR依赖的信号传导通路
2.2.2mTOR非依赖的通路
2.2.3其他通路
2.3自噬体的形成
2.3.1Atg1及其作用伴侣
2.3.2Atg6/Beclin
2.3.3Atg蛋白的翻译后修饰
2.3.4Atg蛋白的转录调节
2.3.5细胞骨架
2.4成熟步骤
2.4.1晚期自噬的形态学和定义
2.4.2成熟事件的调节
2.4.3自噬体的信号传导和成熟
2.5如何调控自噬
2.6结论
参考文献

第3章自噬的生理功能
3.1引言
3.2自噬的生理功能
3.2.1氨基酸池的维持
3.2.2细胞内质量控制（qualitycontrol）
3.2.3自噬选择性降解
3.2.4发育和细胞死亡
3.2.5肿瘤抑制
3.2.6抗衰老
3.3结论
参考文献

第4章自噬与淋巴细胞稳态
4.1引言
4.2细胞因子和MHC/肽配体对T细胞稳态的调节
4.2.1T细胞稳态中的细胞因子
4.2.2T细胞稳态中的TCR-MHC相互作用
4.3内源性和外源性凋亡途径对T细胞稳态的调节
4.3.1T细胞稳态中的外源性凋亡途径
4.3.2T细胞稳态中的内源性凋亡途径
4.4T淋巴细胞中的自噬诱导
4.5自噬：在T细胞生存和死亡中的双重作用
4.5.1在体内自噬促进稳定的T细胞生存
4.5.2自噬促进T细胞死亡
4.5.3自噬作为T细胞中生存和死亡的矛盾介导物
4.6T细胞增殖中的自噬
4.6.1在T细胞增殖中自噬体的形成
4.6.2自噬基因除自噬体形成之外在T细胞增殖中发挥作用
4.7B淋巴细胞中的自噬
4.8结论
参考文献

第5章自噬与固有免疫识别系统
5.1引言
5.2自噬与感应病毒：城堡巡逻
5.2.1病毒的固有免疫识别
5.2.2自噬通过TLR在病毒的固有免疫识别中发挥作用
5.2.3Atg5/自噬在pDC的TLR9信号传导中的作用
5.2.4通过Atg5-Atg12缀合物负调节RLR
5.3固有免疫识别、自噬诱导和吞噬作用之间的相互作用：保卫城堡
5.3.1吞噬作用
5.3.2自噬与吞噬作用的合聚
5.4细胞因子反馈：擂响战鼓
5.5结束语
参考文献

第6章自噬在MHC类内源性抗原提呈中的作用
6.1引言
6.2MHCⅡ类分子肽配体的来源蛋白
6.3细胞内抗原加工到MHCⅡ类蛋白质上
6.4大自噬作为MHCⅡ类配体的来源
6.4.1模式抗原
6.4.2肿瘤抗原
6.4.3细胞内病原体作为大自噬依赖的MHCⅡ类抗原的来源
6.4.4大自噬后自身抗原作为MHCⅡ类抗原表位的来源
6.4.5专职抗原提呈细胞中的大自噬
6.4.6上皮细胞中的大自噬
6.5结论
参考文献

第7章自噬和自噬基因在炎性肠病中的作用
7.1引言
7.2炎性肠病
7.2.1人类炎性肠病的临床表现
7.2.2结肠炎小鼠模型
7.2.3小肠疾病的小鼠模型
7.2.4细菌在炎性肠病中的作用
7.3自噬和克罗恩病
7.3.1鉴定ATG16L1和IRGM1为克罗恩病易感基因
7.3.2Atg16L1在自噬中的作用
7.3.3IRGM1在自噬中的作用
7.4自噬在肠生物学中的作用
7.4.1检测Atg16L1在体内功能的两个小鼠模型
7.4.2Atg16L1缺失导致炎症反应增强且促炎性细胞因子IL1β在巨噬细胞中的表达增加
7.4.3Atg16L1表达降低的小鼠重现克罗恩病的病理表现，揭示Atg16L1在克罗恩病中作用的细胞靶标
7.5结论和未来展望
参考文献

第8章自噬在抵制结构分析杆菌感染的免疫中的作用一种研究自噬免疫功能的模型系统
8.1引言：自噬作为一种抵抗细菌、原生动物寄生虫和病毒的抗微生物防御机制
8.2结核分枝杆菌寄生在宿主巨噬细胞中
8.3自噬消除细胞内结核分枝杆菌
8.4自噬溶酶体在微生物杀灭中的独特性能
8.5自噬是Th1/Th2极化效应物
8.6免疫相关GTP酶（IRG）调节抗微生物防御和炎症中的自噬
8.7自噬是模式识别受体信号传导的效应物
8.8结论和一种模型
参考文献

第9章自噬在防御胞内细菌的免疫中的作用
9.1自噬作为一种抵抗细菌的免疫防御机制
9.2肠道沙门菌鼠伤寒血清型的自噬作用
9.2.1沙门菌相关疾病
9.2.2鼠伤寒沙门菌在哺乳动物细胞中的细胞内生活模式
9.2.3鼠伤寒沙门菌的毒力：Ⅲ型分泌系统及其效应因子
9.2.4防御鼠伤寒沙门菌的自噬作用
9.2.5胞内鼠伤寒沙门菌的多种命运
9.3产单核细胞李斯特菌的自噬
9.3.1产单核细胞李斯特菌的相关疾病
9.3.2产单核李斯特菌在哺乳动物细胞中的生存模式
9.3.3产单核细胞李斯特菌的毒力因子
9.3.4产单核细胞李斯特菌的自噬
9.3.5宽阔的李斯特菌容纳吞噬体
9.3.6不同产单核细胞李斯特菌菌群的多种命运
9.4福氏志贺菌和其他胞内菌的自噬作用
9.5炎性肠病中的细菌自噬
9.6小结
参考文献

第10章A群链球菌与自噬的战争中的失败者
10.1A群链球菌对宿主细胞的入侵
10.2A群链球菌从内吞体中的逃逸
10.3自噬对A群链球菌的捕获
10.4赢家还是输家？
10.5和传统自噬作用的差异
10.6金黄色葡萄球菌感染中的自噬
10.7结语
参考文献

第11章细菌对自噬的策反
11.1伯内特考克斯体
11.1.1细菌形态和抗原变异
11.1.2伯内特考克斯体的Ⅳ型分泌系统
11.1.3伯内特考克斯体的复制小生境
11.1.4自噬途径利于伯内特考克斯体的感染
11.2嗜肺军团菌
11.2.1嗜肺军团菌产生一种专门的细菌区室
11.2.2dot/icm基因复合体编码的Ⅳ型分泌系统
11.2.3嗜肺军团菌对宿主自噬途径的利用
11.3金黄色葡萄球菌
11.3.1金黄色葡萄球菌小细胞突变体
11.3.2全局调节系统agr和sar
11.3.3金黄色葡萄球菌的胞内生存：从吞噬区室中逃逸
11.3.4金黄色葡萄球菌对自噬途径的策反
11.4龈紫单胞菌
11.4.1龈紫单胞菌的胞内生活以及自噬途径
11.4.2牙龈菌蛋白酶的作用
11.5嗜吞噬细胞无浆体
11.5.1嗜吞噬细胞无浆体和自噬途径的相互作用
11.5.2自噬途径利于嗜吞噬细胞无浆体的感染
11.6流产布鲁杆菌
11.6.1流产布鲁菌的胞内小生境
11.7结语
参考文献

第12章刚地弓形虫免疫防御中的自噬作用
12.1前言
12.2CD40和刚地弓形虫感染
12.2.1CD40通过空泡溶酶体融合诱导弓形虫杀灭活性
12.2.2CD40通过自噬作用诱导杀弓形虫活性
12.3刚地弓形虫感染中自噬作用的关联性
12.4结语
参考文献

第13章自噬在哺乳动物抗病毒免疫中的作用
13.1引言
13.2自噬与病毒的战斗
13.2.1自噬抵御嗜神经组织病毒的感染
13.2.2HSV
13.2.3自噬在哺乳动物病毒性疾病中的潜在保护机制
13.3病毒实施逃逸策略
13.3.1HSV1对自噬发动协同攻击
13.3.2病毒Bcl2同系物拮抗宿主自噬
13.3.3自噬逃逸作为一种普遍的毒力机制？
13.4结论
参考文献

第14章有新有旧植物固有免疫和自噬作用
14.1前言
14.2自噬在植物发育和衰老中的作用
14.3自噬和植物固有免疫
14.4自噬限制死亡信号吗？解释HRPCD调节的一个模型
14.5自噬在基础免疫应答过程中的作用
14.6植物RNA病毒和叶绿体
14.6.1病毒在叶绿体内的生理学后果
14.6.2病毒诱导叶绿体向液泡运输：是叶绿体自噬还是被处决的无辜者
14.7液泡中植物病毒的清除
14.8结语
参考文献

第15章自噬在HIV诱导的T细胞死亡中的作用
15.1引言
15.2HIV复制周期
15.3高效抗逆转录病毒治疗和诱导自噬的药物
15.4导致免疫缺陷的机制
15.5自噬在Env介导的CD4T细胞死亡中的作用
15.6自噬在HIV感染的细胞中的作用
15.7结论
参考文献

第16章病毒对细胞自噬途径的策反
16.1引言
16.2对病毒有利的自噬途径
16.3自噬能为病毒做什么？
16.4结论
参考文献
索引